세금계산서 수정 발급 사업자등록번호 변경 홈택스 처리방법

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매월 상가 임대료 '세금계산서'를 발급하고 있습니다. 발급 날짜가 비슷해서 복사해서 발급을 하곤 하는데요.

한번은 세입자가 재발급을 요청했습니다. '사업자등록번호'를 변경해달라는 이유때문이었죠. 세금계산서 수정 발급 사유는 다양하지만 보통 이런 경우는 '기재사항 착오'에 해당되는 부분이라서 수정 자체는 어렵지 않습니다.

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이 글에서는 사업자등록번호 변경시 세금계산서 수정 발급 방법에 대해서 설명드릴게요.

홈택스 세금계산서 수정 발급 두 가지 방법

홈택스에는 '세금계산서 수정 발급'이라는 메뉴가 따로 있습니다만 단점이 있어요. 세금계산서 조회하기 버튼을 누르더라도 수정 사항은 직접 하나씩 입력해야 합니다.

그래서 이미 발급받은 '전자세금계산서 조회' 메뉴의 '발급 목록조회' 버튼을 누르는 방법을 권장해요. 개인적으로 이 경로를 통해서 수정하는 방법이 훨씬 수월하더군요.

세금계산서 목록조회 페이지가 열리면 조회기간 내 발급한 목록이 하단부에 한꺼번에 나타납니다. 수정하려는 세금계산서를 클릭하세요.

해당 세금계산서 상세조회 화면이 열립니다. 하단부 왼쪽을 보시면 수정발급, 복사발급이 보여요. '수정발급'을 누르세요.

세금계산서 수정이 가능한 다양한 사유들

세금계산서 수정 발급 사유 선택 화면입니다. 총 6가지로 나뉘어져 있어요.

• 기재사항 착오정정 : 사업자번호, 금액, 거래처명 등을 잘못 기재한 경우
• 공급가액 변동 : 거래 금액이 변경된 경우
• 환입 : 상품 반품이나 서비스 취소시
• 계약해제 : 거래 자체가 취소된 경우
• 착오에 의한 이중발급 : 실수로 같은 세금계산서를 두 번 발급한 경우
• 면세 등 발급대상이 아닌 거래 : 면세 거래인데 과세로 발급한 경우

조금 헷갈리는 부분도 있어 보이지만, 해당 사항에 맞게 꼼꼼히 읽어보시고 해당되는 사유를 통해 '발급하기' 버튼을 누르시면 됩니다.

작성일자가 같은 날이면서 기재사항 착오 정정 등의 사유는 세금계산서가 2장이 발급됩니다. (당초분 취소 1장과 수정분 1장)

당초 발급된 세금계산서의 취소

자동으로 당초 발급한 세금계산서와 새로 작성하는 세금계산서가 한 페이지에 연달아서 생성됩니다.

당초 발급한 세금계산서는 공급가액과 세액이 마이너스로 표시되고요. 수정사유는 '기재사항 착오정정'입니다.

직접 입력해야하는 새로운 세금계산서

새로 작성하는 세금계산서의 경우는 당연히 수정을 하셔야 하는데요. 사업자등록번호 변경의 경우는 거래처 조회를 통해서 자동으로 불러오거나 직접 입력을 해야 합니다.

미리보기 화면으로 확인해보면 공급가액과 세액은 변동이 없고, 공급받는자의 정보만 변경되어 있음을 알 수 있습니다. 수정사유도 '기재사항 착오정정'이고요.

💡 2025년 업데이트 사항
홈택스 인터페이스가 지속적으로 개선되고 있습니다. 메뉴 위치나 명칭이 약간 다를 수 있지만 기본 흐름은 동일해요. 수정세금계산서 발급시 익월 10일까지 완료하면 가산세를 피할 수 있습니다.

Q. 사업자등록번호를 잘못 기재하면 어떤 문제가 있나요?
공급받는자가 부가세 매입세액공제를 받을 수 없게 됩니다. 또한 거래증빙으로 효력이 없어져서 반드시 수정발급을 해야 해요.

Q. 수정세금계산서 발급에 기한이 있나요?
기재사항 착오정정의 경우 익월 10일까지 발급하면 가산세가 부과되지 않습니다. 다만 부득이한 경우 확정신고 기한까지는 발급 가능해요.

Q. 수정세금계산서를 또 수정할 수 있나요?
네, 가능합니다. 다만 너무 자주 수정하면 세무조사시 불이익이 있을 수 있으니 처음부터 정확하게 작성하는 것이 좋아요.

Q. 수정세금계산서 발급 비용이 있나요?
홈택스를 통한 전자세금계산서 수정발급은 무료입니다. 다만 세무대리인을 통해 처리하면 수수료가 발생할 수 있어요.

⚠️ 주의사항
수정세금계산서 발급 후에는 반드시 거래처에 알려주세요. 특히 사업자등록번호가 변경된 경우 공급받는자가 올바른 번호로 매입세액공제 신청을 할 수 있도록 해야 합니다. 또한 수정 사유를 정확히 선택하지 않으면 가산세가 부과될 수 있으니 주의하세요.

여기서는 작성일자가 동일한 가정하에 세금계산서 공급받는자의 사업자등록번호 변경으로 다시 발급한 사례에 대해서 설명드렸는데요. 세금계산서 수정 발급 사유는 천차만별이니 다양한 사례를 접해보시고 본인 상황에 맞는 방법을 적용해서 발급하시길 바랍니다. 확실하지 않은 경우에는 세무서나 세무대리인에게 문의해보는 것이 가장 정확해요~